マイクロスコープで観察し、表示された画像にノイズが含まれている場合、他の処理にとりかかる前にはノイズ除去（平滑化）を行っておく必要があります。

ノイズ除去にはいくつかの方法があり、「移動平均フィルター処理」は、ノイズ部分を周辺画素の平均値に置き換えることで、ノイズを除去する方法です。

また「メディアンフィルター処理」は、ノイズ部分の画素を、周辺画素の中央値に置き換える方法で、移動平均フィルター処理に比べて、画像のエッジが損なわれない結果を得ることができます。